本发明公开了一种增强LoraWan网络架构安全性的加密方法、系统及存储介质，包括：获取预先构建的CA与代理节点协议；利用所述CA与代理节点协议，获取代理节点组内各代理节点的公钥，控制当前CA将各代理节点的公钥分发给代理节点组内每个代理节点成员用于各代理节点成员保护其信任值表；控制当前CA接收各代理节点成员发送的受公钥保护的信任值表，并控制当前CA计算各信任值表内信任值的平均值，基于平均值创建最终信任值表，发送最终信任值表至终端节点；接收到终端节点与代理节点组共享数据的请求，控制代理节点组内最高信任值的代理节点成员接收终端节点发送的共享数据。本发明基于现有密钥管理方案，验证了所有安全目标，保证了认证的机密性和完整性。