本发明公开了一种用于钻机举升与升沉补偿的控制方法及系统，控制系统包括油源、气源、液压控制系统、气压控制系统、平衡系统和举升系统，所述液压控制系统用于控制所述油源供油，从而给所述平衡系统和所述举升系统提供油压，所述气压控制系统用于控制所述气源供气，从而给所述平衡系统提供气压，所述气压控制系统配合平衡系统用于平衡所述举升系统产生的压力变化。本发明实现了起下钻升降和升沉补偿钻进通过一套举升油缸同时进行，减少了井架上额外用于补偿的油缸。