本发明公开了一种低容抗保护方法及系统，其中方法包括：获取线路的三相电流及电压的采样值，针对所述采样值确定三相电流的相量值及电压的相量值；根据比值确定对地容抗；根据线路阻抗参数确定低容抗保护动作区，并确定所述低容抗保护动作区内的关键定值；进行幅值补偿或软补偿；当经过幅值补偿或软补偿后，对地容抗进入低容抗保护动作区且两侧电流相量和的幅值满足电流多点确认的判据时，对线路进行低容抗保护动作。本发明方法原理简单，能够准确快速识别线路故障，提高了线路保护的可靠性。