本发明提供了一种适用于日冕仪的温控系统，其特征在于，包括传感组件、加热组件和调温组件，调温组件包括加热驱动模块和温度采集模块；传感组件安装于被测设备端，传感组件通过转接线与调温组件的温度采集模块连接；调温组件安装于被测设备端，调温组件通过转接线与调温组件的加热驱动模块连接；调温组件通过自主补偿的方式进行温度采集并通过增量PID算法进行温度控制，使被测设备端稳定在设定温度阈值范围内。本发明还提供了一种适用于日冕仪的温控方法和应用该温控系统的设备。本发明中的温控系统可靠性强、自动化程度高并且对于设备体积小，安装位置小，采用蓄电池供电等飞行器设备适用来说，该温控系统具有体积小，成本低，操作方便特点。