本发明提供了一种硅钙镁肥土壤调理剂及其制备方法和应用，涉及土壤改良技术领域。本发明所述硅钙镁肥土壤调理剂的原料主要由白云石、麦饭石等矿物组成，材料来源广泛且价格便宜，且所述硅钙镁肥土壤调理剂中含有大量的硅、钙、镁、钾等元素，可用作肥料。本申请首次将其应用于土壤重金属污染修复，尤其北方微碱性石灰性土壤的重金属污染修复。本发明实施例中通过盆栽和大田实验证实，所述硅钙镁肥土壤调理剂可提高土壤pH值0.48～0.91，显著降低土壤DTPA态镉含量；显著降低土壤可交换态镉含量和碳酸盐结合态镉含量，提高了铁锰氧化物结合态、有机结合态和残渣态镉含量；显著降低小麦各个器官中镉含量。