本发明提供一种复杂喀斯特地质中土石地基施工方法及施工结构，该方法是在地基基础施工遇到凹凸不平的持力层及泥槽时，先清理泥槽，对于深度大于1.5B的深泥槽区域，清理深度大于等于1.5B，深度小于等于1.5B的浅泥槽区域全部将泥土清理完毕，达到换填条件后，施工级配砂石褥垫层，B指基础的长边；级配砂石褥垫层的扩边区从基础的外边缘外延长度大于等于300mmm，保证基础的受力要求；级配砂石褥垫层施工完成后，在级配砂石褥垫层的上方及基础的正下方施工混凝土垫层，混凝土垫层宽度分别比基础外边延伸至少150mm。以解决喀斯特地质中基础施工技术难题，克服现有技术的不足。属于建筑地基施工领域。