本发明公开一种林业数据协同处理系统，属于林业大数据技术领域，包括网络层、数据层、业务层和应用层，通过数据映射器和数据协同转换协议实现异构数据之间的交换与共享；实现横向业务直接的数据协同，纵向上下级直接的数据协同。本发明采用基于林业资源数据的数据映射器，解决了数据内容不同、数据结构不同、跨数据库的数据同步问题，从而有效地实现了部门内，跨部门、跨级别的数据协同。采用本发明的系统与传统工作方式相对比，同样工作量效率可以提升50％以上，不仅节约了时间投入，而且减少了经济开支。