本发明提供了一种基于冻结电流的配电网台区拓扑关系自动识别方法及系统，设置冻结电流异动阈值，判断电流异动是否超过设定阈值，如果是则通过广播的方式向所有低压故障传感器发送冻结命令，在同一时间将电流信息冻结；通过轮询的方式依次抄读所有低压故障传感器的带有时间戳的电流冻结数据，并对将本次冻结数据与上次冻结数据做计算，确定包含电流增量、谐波增量和漏电流增量信息的相关参数；根据冻结电流的相关参数，进行数据分组和分支分析，根据不同的主分支识别结果进行层级分析，确定配电网台区拓扑结构。本发明能够实现低压拓扑自动识别。