本发明公开了一种凉粉草脱毒苗的高效育苗方法及其应用。本发明包括如下步骤：扦插基质消毒处理、配制生根营养剂、插穗处理及扦插、扦插后的管理和移栽种植等。本发明可以大大缩短凉粉草脱毒种苗育苗周期，大幅度提升繁殖效率，经过15d的培育和管理即可长成适合移栽的种苗；扦插成苗率达100％，大田移栽成活率在99.0％以上；本发明操作简便易行，生产周期短，具有成本低、节省空间与劳力、清洁卫生等优点，利于推广；成本低，仅为组织培养方法成本的20％左右，很好地解决了凉粉草优质种苗的快速繁殖，可初步实现工厂化生产。本发明不仅能为凉粉草优良脱毒苗的繁育提供高效繁殖方法，而且也为其产业化种植提供优良苗木保障。