本发明公开了一种基于运输船体的水域生态污染治理装置，属于水域生态治理设备技术领域。包括船体结构以及设于船体结构的主动调向结构、垃圾收集挡栏、同步传动结构和垃圾储放箱，该装置能够在船体结构运输货物时，使垃圾收集挡栏与垃圾储放箱随着船体结构进行同步航进；并通过人力方便地操控主动调向结构调节垃圾收集挡栏在使用和非使用时的工作状态及位置，同时借助同步传动结构使得主动调向结构的调节驱动力能够同步传递至垃圾储放箱，保证垃圾储放箱能够自动调节在使用和非使用时的工作位置，进而以此完成船体结构在整体运输航进过程中对水面漂浮垃圾的收集清理，将水上垃圾清理与水上运输相结合，提升了功能性以及对水域垃圾的清理频率。