本发明公开了一种差速脱粒滚筒及其脱粒系统，脱粒滚筒包括喂入搅龙组件、低速脱粒滚筒组件和高速脱粒滚筒组件，低速脱粒滚筒组件包括低速筒体和低速轴，喂入搅龙组件和低速筒体均与低速轴同轴固接，低速轴的一端设置为动力输入端，高速脱粒滚筒组件包括同轴固接的高速筒体和高速轴，高速轴的一端与低速轴的另一端枢接，另一端设置为动力输入端。本发明的差速脱粒滚筒的两个滚筒的动力采用非同侧输入的方式，相较于现有差速脱粒滚筒采用齿轮传动且将动力输入方向为同侧的方案，解决了现有差速脱粒滚筒前后滚筒转速比无法调节的问题。