本发明涉及一种野生早樱组织培养快速繁殖系统及其方法，包括承载箱、辐照光源、混料罐、蠕动泵、集液槽、承载托盘、导向滑轨及驱动电路，导向滑轨与承载箱侧壁连接，集液槽通过导向滑轨与承载箱侧壁滑动连接，承载托盘通过导向滑轨与承载箱侧壁滑动连接，混料罐通过导流管与蠕动泵连通，蠕动泵另通过分流管分别与各集液槽连通，驱动电路嵌于承载箱外侧面。其培育方法包括系统预制、砧木萌发培育及砧木萌发育根三个步骤。本发明一方面可实现萌芽、育根炼苗同步进行，从而有效的提高了植株培育作业的工作效率；另一方面可根据植株培育不同阶段灵活调整培育调剂及环境，极大的提高了培育繁殖的成功率。