本发明公开了一株产尿素细菌菌株及其在烟草栽培中的应用，该菌株为短短芽孢杆菌Brevibacillus brevis；保藏名称为短短芽孢杆菌Brevibacillus brevis PE01菌株；保藏于中国典型培养物保藏中心，保藏地址是中国.武汉.武汉大学；保藏日期：2020年11月27日；保藏编号:CCTCC NO.M 2020783。本发明利用PE01菌株制备的微生物肥料在烟草栽培中可以替代30％化学肥料而不影响烟叶产量。本发明的利用PE01菌株制备的微生物肥料，具有使用成本低、环保安全、无残留、对人畜安全的特点。