本发明涉及微生物发酵技术领域，特别是涉及一种嗜热链球菌(Streptococcusthe rmophilus)IMAU80287Y菌株及其应用、酸奶及其制备方法。本发明提供一种嗜热链球菌IMAU80287Y菌株，所述菌株的保藏编号为CGMCCNo.22260。本发明提供的IMAU80287Y菌株不仅发酵性能良好，而且可以代谢半乳糖；由实施例可知，本发明提供的IMAU80287Y菌株在牛乳发酵和贮藏期间代谢乳糖和半乳糖的能力较原始菌株分别提高了6.2％和25％。利用本发明所述IMAU80287Y发酵得到的酸奶，持水能力显著高于原始株发酵乳，发酵性能良好。