本发明公开了一种消毒灭菌方舱，包括固定舱、扩展舱；固定舱包括去污区和第一洁净室；扩展舱包括缓冲区和第二洁净室；第一洁净室和第二洁净室组成洁净区；当消毒灭菌方舱展开后，去污区、缓冲区和洁净区物理隔离；去污区内设置有负压装置，洁净区设置有正压装置；消毒灭菌方舱设置有第一热风设备和第二热风设备，分别用于给去污区和洁净区提供热风，且为独立热风送风回风设计。本发明所设计的一种消毒灭菌方舱，遵循了卫生计生委标准要求，在单扩舱内实现了去污区、洁净区及缓冲区的物理隔离分区，在舱内实现了基于分区压差隔离功能，实现气流定向流动，实现了物资和人员的定向流动，最大限度的降低了消毒灭菌作业过程中交叉感染的可能。