本发明提供一种综合能源系统经济调度优化方法、系统、设备及存储介质，方法包括：获取综合能源系统的日前经济调度场景相关原始数据；根据所述原始数据，建立以包含能源购买成本和电储能的充放电折旧成本的综合能源系统经济运行最小化为目标的综合能源系统日前经济调度优化目标函数，建立涵盖综合能源系统的功率平衡、外部能源供应和设备运行的综合能源系统日前经济调度约束条件；基于综合能源系统日前经济调度优化目标函数和综合能源系统日前经济调度约束条件，采用多群体粒子群算法求解综合能源系统日前经济调度最优方案。该方法优化能源供应，实现多能源间横向协同互补和纵向梯级利用，促进分布式可再生能源消纳，提高能源利用率。