本发明提供的一种熔融碳酸盐燃料电池堆卧式组装装置及方法，属于电池堆组装技术领域，熔融碳酸盐燃料电池堆卧式组装装置包括：框架，下端可调节的设置有组装平台；电池堆适于竖直放置在所述组装平台上；顶板，通过调平螺母设置在所述框架的一侧，所述调平螺母用于调节顶板的垂直度；驱动装置，设置在框架的设置所述顶板相对的一侧；压板，具有相对设置的第一压板和第二压板；所述第一压板和第二压板之间通过制紧螺杆连接；绝缘板，设置在电池堆和压板之间；所述绝缘板具有第一绝缘板和第二绝缘板；本发明的熔融碳酸盐燃料电池堆卧式组装装置，结构设计合理，与现有设备的兼容性好，操作简单。