本发明涉及一种用于与成纤维细胞生长因子受体(Fibroblast growth factor receptor，FGFR)1、2或3基因杂交的DNA探针库及应用，属于生物医药技术领域。本发明提供了一种用于与FGFR1、FGFR2或FGFR3基因杂交的DNA探针库，DNA探针包括SEQ ID NO.1‑186所列举的全部探针。本发明提供了一种利用DNA探针库富集FGFR1、FGFR2或FGFR3基因片段，并与下一代测序技术(NGS)结合检测相关融合变异的方法。使用本发明的基因富集方法和筛选得到的特定DNA探针库，应用下一代测序技术可以准确地获得FGFR1、FGFR2或FGFR3基因中的融合变异。具有检测通量大、准确性高、周期短、敏感性高的优点。