本发明公开了一种电子案卷的转档系统，系统中，通过客户端的身份识别，案卷复核部对卷宗文档的内容分割内容区并确定每一内容区标准坐标数据，案卷审查部生成阅卷参数，利用阅卷参数查找案卷文档唯一的页面的唯一内容区，签名校验部提取多个即时特征图与基础特征图进行校验，校验不成功关闭案卷读取部，案卷读取部利用标准坐标数据删除至少一个页面图像的内容区，案卷输出部生成处理后的具有身份标识的电子卷宗，该系统实现了只需要一个身份验证和签名就能提取所需要的、相应权限可操作的案卷内容，既保护电子卷宗案卷内容的安全隐私，也减少了需预约操作案卷相关内容的环节，提高效率。