本发明提供了一株伯克霍尔德氏菌、包括伯克霍尔德氏菌的菌剂、菌肥及制备方法和应用，属于微生物制剂技术领域。本发明的伯克霍尔德氏菌(Burkholderia sp.)K2h，保藏编号为：CGMCC NO.22001，其通过产生活性物质抑制辣椒疫霉病菌的生长，对辣椒疫病表现出较好的防治效果，抑制率最高可达90.01％。同时，其能有效在辣椒根茎叶上定殖，改善农作物微生态环境。室内盆栽药效结果表明，K2h菌剂对辣椒病病防效为88.63％，且不易产生抗药性。应用时在辣椒幼苗期或成株期灌根使用。该菌剂也可与有机肥混合制成菌肥使用。