本发明公开了一种基于MRI多模态神经成像评估脊髓损伤程度的方法，基于MRI扫描损伤部位、高位颈脊髓和腰膨大以获得多模态神经成像，使用医学影像处理软件对神经成像中的靶区进行勾画，根据医学影像处理软件逐层计算整体脊髓面积、脊髓灰质、脊髓白质、后索高信号以及后索的以定量评估神经退变，能够从多角度多方面特别是神经微观结构反映病变组织的综合信息，让研究者和医生可以进行系统性的客观定量评估中枢神经系统继发性损伤的严重程度，还能对患者远期的预后进行预测。