本发明提供一种2‑氨基‑6‑氯鸟嘌呤及其中间体的制备方法。其中，中间体的制备方法包括：2,4‑二氨基‑5‑亚硝基‑6‑羟基嘧啶溶于溶剂A和N,N‑二甲基甲酰胺中，升温至回流，滴加三光气溶液，保温反应，反应结束后，后处理得所述2‑氨基‑6‑氯鸟嘌呤的中间体化合物II；然后进一步得到中间体III～IV以及2‑氨基‑6‑氯鸟嘌呤。本发明的2‑氨基‑6‑氯鸟嘌呤及其中间体的制备方法，采用2‑氨基‑6‑氯鸟嘌呤的合成方法，不仅避免了传统工艺中以价格更昂贵的鸟嘌呤为起始原料和三氯氧磷进行氯化反应的工艺，同时克服了传统工艺中大量难以处理的高磷高氨氮的废水的产生。