本发明创造提供了一种质子交换膜燃料电池阴极压力及流量观测方法，包括以下步骤：S1：建立燃料电池空气系统集总参数模型；S2：基于该模型设计自适应观测器对阴极腔压力和阴极入口流量进行观测；S3：观测器设计过程考虑中冷器导致的歧管进出口温差，保证观测器收敛；S4：将燃料电池系统的可测量信号输入到观测器中，通过实时迭代运算实现阴极流量和压力的实时精确观测。本发明创造所述的一种质子交换膜燃料电池阴极压力及流量观测方法，具有信号采集的传感器布置方便，可实现性强、有效增加观测精度、高燃料电池功率点迁移时瞬态工况的控制效果。