本发明属于海底有覆盖管道的天然气水合物开采技术领域，更具体地，涉及有覆盖层的天然气水合物的开采管道及处理系统及其开采方法，包括竖向设置的生产管道，生产管道的一端设为封闭端，另一端设为开口端，还包括利用降压燃烧方法收集天然气的降压燃烧管道和利用二氧化碳驱替法采集天然气的二氧化碳驱替管道；所述的降压燃烧管道横向设置，一端与所述的生产管道连通，另一端为封闭端；所述的二氧化碳驱替管道横向设置，一端与所述的生产管道连通，另一端为封闭端；在所述降压燃烧管道与所述二氧化碳驱替管道之间的生产管道中设置有封隔器，在所述生产管道的管口处也设有封隔器；本发明经济环保，并且能够避免热量损失，提高天然气的开采效率。