一种调速器智能分段关闭控制系统及方法，该系统包括人机交互装置、PLC控制器、分段关闭装置、导叶接力器、导叶位置传感器、行程换向阀、电磁阀、主回路切换阀组、回油箱、压油罐、接力环、监控系统、并网开关。PLC控制器根据导叶开度模拟量信号、并网开关状态信号、紧急停机命令和分段关闭装置动作点所对应的导叶开度y1，通过输出控制信号，控制电磁阀的励磁线圈是否励磁来实现电磁阀油路切换，从而控制分段关闭装置的控制油管通断，继而控制分段关闭功能是否投运。本发明可以避免机组正常运行时，分段关闭装置无意义的动作，避免分段关闭装置长期高频动作导致设备磨损；避免导叶开度异常波动，保证机组安全稳定运行。