本发明属于配电网故障诊断技术领域，公开了一种基于拓扑知识的配电网故障诊断系统、方法及计算机程序产品，所述基于拓扑知识的配电网故障诊断系统包括：数据获取模块、数据预处理模块、故障特征提取模块、数据融合模块、中央控制模块、模型构建模块、故障诊断模块、诊断评估模块、数据存储模块、更新显示模块。本发明通过故障特征提取模块能够获得基于时间序列的配电网故障特征；通过中央控制模块进行PID控制，在误差信号较大时投入了积分调节，加快系统的响应速度，控制精度高，具有较好的控制性能；通过故障诊断模块利用构建的配电网故障诊断模型进行配电网故障的诊断，能够实现对配电网故障的简捷及准确定位，且故障诊断准确度高，泛化能力和鲁棒性好。