本发明提供一种测试配网用电子式互感器误差的系统和方法，所述系统和方法在对待测配网用电子式互感器与电子互感器校验仪，以及待测配网用电子式互感器相对应的标准互感器与电子互感器校验仪进行电气连接后，通过在误差测试单元中按照选择的测试模式设置测试内容，标准互感器和待测配网用电子式互感器的一次和二次额定值，待测配网用电子式互感器二次负荷等参数后，进行误差测试并在线显示输出数据和测试结果。所述方法和系统采用数字方式输出互感器数据，有利于变电站智能化发展，而且基于误差测试单元进行误差测试功能强大，可以直观的显示波形和各种有效数据，并具有数据存储、离线分析、数据打印、数据查询等功能，方便数据处理。