本发明提出一种移动终端辅助的脑卒中交互式锻炼控制系统，包括与所述移动终端通过远程通信链路连接的嵌入式交互式锻炼设备，所述嵌入式设备包括预定大小的内存空间和交互式人机界面；所述预定大小的内存空间包括第一地址段空间和第二地址段空间；第一地址段空间用于存储交互锻炼指示数据，交互锻炼指示数据用于指示脑卒中患者的锻炼动作；第二地址段空间用于存储交互锻炼期望数据，交互锻炼期望数据用于显示基于所述交互锻炼指示数据所预期的期望指标值；所述嵌入式设备接收所述移动终端的辅助指令，基于所述辅助指令调节所述第一地址段空间和第二地址段空间的大小。本发明的技术方案能够在有限的内存空间下实现全流程的脑卒中交互式锻炼。