本发明涉及一种绞吸挖泥船的旁通吸入吹水工艺控制方法，该方法根据施工需求，通过上吸口进舱闸阀和旁通吸入闸阀协同控制，并辅以水下泥泵和舱内泵转速的调整，可实现疏浚模式和旁通吸入模式的控制切换；疏浚模式下，旁通吸入闸阀关闭，疏浚介质依次经绞刀吸口、水下泥泵、上吸口进舱闸阀、舱内泵吸口闸阀，再经舱内泵排出；旁通吸入模式下，上吸口进舱闸阀关闭，海水依次经旁通吸入闸阀、舱内泵吸口闸阀，再经舱内泵排出，达到吹洗排泥管路中残留的疏浚介质。本发明通过旁通吸入模式与疏浚模式的控制切换，实现了对桥架结构内设备的维修更换和排泥管线吹洗的同步进行，有效避免了排泥管吹洗操作占用设备检修维护时间，提高施工效率，降低油耗。