本发明涉及纳米材料制备技术领域，具体涉及一种聚多巴胺修饰的纳米共价有机框架及其制备方法与应用，所述聚多巴胺修饰的纳米共价有机框架PDA@COF以共价有机框架为核，以其表面修饰的聚多巴胺为壳；所述共价有机框架为1,3,5‑三(4‑氨基苯基)苯与2,5‑二烯丙氧基对苯二甲醛以碳氮双键连接的席夫碱型的共价有机框架，PDA@COF的粒径小于200nm，COF和PDA的质量比为0.5～1.5:1。本发明中COF材料表面成功修饰聚多巴胺后，PDA@COF具有很好的光热能力，因此在肿瘤的热疗中具有很大的潜能；本发明中制备的COF和聚多巴胺都具有良好的生物相容性以及易于修饰的特性，为PDA@COF材料进一步的修饰和在生物医学方面提供了更加广阔的应用空间。