本发明公开了一种当归的近红外在线质量检测方法，包括以下步骤：（1）样品制备：取不同产地、不同批次的当归饮片样品；（2）近红外光谱数据采集：同时采集并记录当归样品的近红外光谱图和当归打粉后的近红外光谱图；（3）对光谱数据进行预处理：分别采用原始光谱、一阶求导、二阶求导、多元散射校正、矢量归一化、卷积平滑滤波、多元散射校正+矢量归一化、卷积平滑滤波+多元散射校正、卷积平滑滤波+矢量归一化对光谱数据进行预处理；（4）采用卷积神经网络、偏最小二乘回归方法或分段PLSR进行模型筛选，建立当归定量校正模型。本发明方法操作快速、简单，所建立的模型准确可靠，可用于当归饮片中阿魏酸和水分含量的定量分析。