本发明涉及一种清心莲子饮HPLC特征图谱的检测方法及该特征图谱的应用，利用高效液相色谱法，以多个对照品作为参照峰，以磷酸‑乙腈作为流动相进行梯度洗脱，通过对色谱条件进行系统化合理控制，能够同时认定13个共有峰，构成了清心莲子饮药物特征图谱的全貌，经过指认的共有峰有6个，使清心莲子饮药物的质量控制从原来针对一个或两个成分的含量测定或少数几个共有峰的检测上升到针对整个清心莲子饮药物内在品质的把控，能够比较全面地反映清心莲子饮药物的特征，避免了只检测单一或少数几个共有峰而带来的方法缺陷，为清心莲子饮药物的内在质量控制提供了新的分析手段，并达到控制清心莲子饮中原药材的目的。