本发明公开了一种基于分离式存储的电子合同文件的分组加密方法，分组加密模块会以分离式存储的方式将分组加密后的密文保存到不同的存储数据库中，并将各个加密结果存储的位置及密文个数进行拼接得到第二拼接结果。本发明不仅能够针对分离式存储设备的不同对电子合同进行加密，使得同一文件针对不同的分离式存储设备加密的结果不同，还能够对电子合同进行分组加密，并将不同的密文存储到不同的数据库中，使得对数据的保存更加安全，不同的组对应不同的密钥解密密钥，同时相邻解密密钥相互之间还存在联系，在解密时，中间的某组的解密密钥出现错误，该组及后面所有组的密文均无法成功解密，有效提升了电子合同的安全性。