本发明公开了一种基于电能量数据的补采方法、系统及存储介质，基于电能量数据的补采方法包括：根据预设调度任务定期采集供电单位的补采对象的数据完整率；根据供电单位和预设补采规则数据库确定供电单位对应的预设补采规则，预设补采规则数据库包括：供电单位和预设补采规则的第一匹配信息；将数据完整率和所述预设补采规则对应的预设完整率阈值进行比较以确定补采结果；获取补采对象的电能表数量，并根据电能表数量、预设补采规则和补采结果确定补采任务；将补采任务下发至供电单位对应的通讯地址。通过自动化进行补采分析，且形成对应的补采任务下发至对应的供电单位，节省人力且提高数据补采的效率。