本发明公开了一种鸡感染空肠弯曲杆菌的分子标记及检测方法和应用，该分子标记为鸡盲肠组织gga‑miR‑24‑3p的异构体isomiR‑1，核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。通过以鸡盲肠组织总RNA反转录的DNA为模板进行PCR扩增，经内参校正后，待检鸡isomiR‑1的表达量超过阴性鸡6倍以上则判定为空肠弯曲杆菌阳性鸡。本发明通过检测鸡盲肠组织gga‑miR‑24‑3p异构体isomiR‑1的表达水平，以确定其是否已感染空肠弯曲杆菌，是一种新型的分子标记方法。