本发明公开了一种多通道原子滤光昼夜自动切换装置，包括望远镜，还包括与望远镜对应的光纤、准直镜、原子滤光器、聚焦镜和光电探测器，原子滤光器设置在滑动平台上，电机驱动滑动平台移动至行程首端时，原子滤光器插入到准直镜与聚焦镜之间的光路，电机驱动滑动平台移动至行程尾端时，原子滤光器移出准直镜与聚焦镜之间的光路。本发明可以同时控制多路原子滤光器等高性能滤光系统的插入和移出，利用环境光电探测器对激光雷达接收望远镜周围光照环境进行实时监测，结合光照度阈值，实现了对激光雷达白天夜间两种工作模式的分辨，使得高灵敏的光电探测器能够得到有效地保护。