本发明公开了一种清洁系统和滤清器清洁方法，属于清洁技术领域。该清洁系统包括输送机构、辅助清洁通道和主清洁通道，输送机构沿输送方向输送制品；辅助清洁通道包括除静电装置，所述除静电装置设置于所述输送机构的旁侧，用于消除所述制品的自身静电；主清洁通道包括吹尘装置，所述吹尘装置跨设于所述输送机构上，消除静电后的所述制品通过所述输送机构经过所述吹尘装置。实现制品先经过除静电，降低浮尘在制品表面的吸附力，然后再进行吹尘的处理流程，提升了制品表面的清洁度，保证了制品的表面洁净和美观。