本发明涉及一种可用于快速准确检测室间隔缺损的分子标记物，该分子标记物为DDIT4基因，发明人研究发现DDIT4的表达量只在VSD患儿中显著升高，通过定量分析外周血中DDIT4基因的含量即可检测VSD。本发明具有取材方便、操作简单、特异性强、快速准确、结果稳定等优点，能及时、快速、客观、准确诊断VSD，尤其是通过一次实验即可将VSD与ASD和PDA分开，有传统诊断方法所不具备的优势。因此，本发明对VSD患儿的快速诊断具有极大的临床应用价值，为进一步研制出VSD快速诊断试剂盒提供了方向性。