本申请提供一种变压器高次谐波传递函数辨识方法，包括以下步骤：建立变压器高次谐波传递特性电路模型；根据电路模型，设计用于辨识高次谐波传递函数的输入谐波信号；在变压器一次侧注入输入谐波信号并测量得到二次侧输出谐波信号；根据所述输入谐波信号和所述输出谐波信号，通过传递函数辨识算法，获得变压器高次谐波传递模型。采用本发明提供的方法可以快速获得变压器高次谐波传递模型，尤其是针对变压器寄生参数，较理论分析和数值计算更加接近实际，有很好的工程应用价值。