本发明公开了一种柔性直流输电控制系统链路延时的实时测试系统及方法，包括：通过采集测量装置接收实时仿真器经高速接口板卡送出的正弦交流电压信号，并进行电压转换、硬件滤波、数模转换与调制处理后转换成触发脉冲信号；通过接口装置将触发脉冲信号送入实时仿真器，并将实时仿真器中各柔直换流阀子模块的状态信息反馈至控制链路；在接收到脉冲触发信号后触发子模块单元输出对应的触发交流电压，计算同步交流电压信号与所述触发交流电压信号的延时，并去除高速接口板卡及接口装置中的延时，以得到控制链路的延时。本发明能够避免获取直流控制保护系统输入信号由于无法准确获取过零点，或判断过零点时需要引入预设电压阈值而导致测量困难的问题。