本发明适用于计算机领域，提供了一种图数据存储方法及系统，将获取的数据保存在对应的存储单元中，并定期计算存储单元内存使用量占比；不断监控判断中心存储单元内存使用量占比是否大于溢满占比，即定时监控中心存储单元的内存是否即将用完，当中心存储单元内存使用量占比大于溢满占比的时候，将中心存储单元中的数据自动迁移至与其相连的一级存储单元。通过将中心存储单元中的数据迁移至一级存储单元中，使得中心存储单元的内存得到释放。解决了现有技术中固定的存储单元，在存储数据时出现数据存储量失衡，导致有些存储单元负荷过大，运转速度变慢的问题。