本发明公开了一种柔性直流换流器的谐波电流抑制方法、装置及存储介质，所述柔性直流换流器的谐波电流抑制方法包括：获取待抑制的谐波次数以及电网电压中背景谐波的幅值和相位；将所述背景谐波经过相位延时后，生成谐波调节量；在柔性直流换流器电流内环控制输出端串联谐波陷波器，得到经过谐波陷波器处理后的调制波；在所述经过谐波陷波器处理后的调制波上叠加所述谐波调节量，以对柔性直流换流器的谐波电流进行抑制。本发明实施例无需改变原有控制环结构，计算量小，能够在降低对柔性直流换流器动态性能及稳态特性的影响下，实现对谐波电流的抑制。