本发明公开了一种红霉素降解菌IURM F69及其应用，属于生物技术领域，本发明提供的红霉素降解菌及其应用，通过微生物筛选处理技术，即根据红霉素的理化性质，在特定环境条件中筛选或者通过改造，得到能够降解红霉素的微生物，以大环内酯酶，转移酶，裂解酶等酶类对红霉素结构进行破坏，得到极小危害的代谢产物，从而达到红霉素无害化处理的目的，实验证明，本发明的红霉素降解菌IURM F69能在仅以红霉素为碳源的特殊环境中存活，达到48％‑67％的降解效率，相关酶降解红霉素的活性高，本发明所提供的红霉素降解菌IURM F69可以应用于污染环境中的红霉素降解，在菌渣固废处理和水污染处理方面具有很好的应用价值。