本发明公开了一种ssDNA核酸适配体及其在识别大口黑鲈虹彩病毒感染细胞中的应用，所述ssDNA核酸适配体的核苷酸序列为5’‑GGCGGTCCCGATGGCGAGCAAGCCAATAACCC CCCATGCACATCGTTAGT‑3’(SEQ ID NO：1)或5’‑GACGCTTACTCAGGTGTGACTCGGGCGGTCCCGATGGCGAGCAAGCCAATAACCCCCCATGCACATCGTTAGTCGAAGGACGCAGATGAAGTCTC‑3’(SEQ ID NO：2)。本发明的ssDNA核酸适配体对大口黑鲈虹彩病毒感染的细胞具有特异性和高灵敏度，且无免疫原性。该核酸适配体结构稳定、易修饰，便于合成和保存，可对大口黑鲈虹彩病毒感染的细胞进行快速准确的检测。