本发明公开了用于结直肠癌预后评估的基因标志物，其包括以下基因：CASP6、CLOCK、DENND6A、LARP1、SLC36A4、SERBP1、ST7L、SEC22C、USP33。本发明的基因标志物是基于进化理论筛选得到，筛选的过程考虑到了癌症细胞与进化之间的关联，并且经过实验与临床验证，通过本发明9个基因标志物的表达水平能够对结直肠癌病人预后的生存时间上具有很好的区分能力，其可作为有效的生物标记物对结直肠癌病患进行预后评估，以能够对病患进行有效地、个性化的防护与治疗，并且本发明的基于进化理论筛选结直肠癌预后评估的基因标志物的方法可推及到其他的癌症预后基因标志物的筛选，为开发有效的生物标志物提供新的思路。