本发明涉及一种电‑气综合能源系统状态估计方法和系统，包括：获取电‑气综合能源系统中多种量测量的采样值；基于电‑气综合能源系统中多种量测量的采样值，利用粒子群算法对预先构建的电‑气综合能源系统状态估计模型进行求解，确定电‑气综合能源系统中多种状态量的估计值；其中，所述电‑气综合能源系统状态估计模型以基于最小二乘法原理构建的多种量测量分别对应估计值的估计误差总和最小为目标确定多种状态量的估计值。本发明提供的技术方案能克服传统方法中因综合能源系统中多元化数据带来的估计精确性下降以及计算速度缓慢问题，能够实时反映综合能源系统内部运行状态，为综合能源态势感知工作奠定基础。