本发明公开了一种电流互感器误差在线监测系统及方法，包括：信号注入单元根据接收的信号注入指令注入预设频率的电压信号至第一高频线圈；第一高频线圈根据所述电压信号向电流互感器的二次回路中感应电流信号；第二高频线圈感应所述电流互感器的二次回路中的电流信号；电流信号检测单元对输入至第一高频线圈一次侧的电流信号进行检测，以获取第一电流信号；高频信号检测单元对所述第二高频线圈二次侧的电压信号进行检测，以获取第一电压信号；信号处理及控制单元根据所述第一电流信号和第一电压信号计算所述电流互感器的运行误差；本发明能够大幅减少由电流互感器计量性能检测带来的计划性停电事件，保证电网安全稳定运行。