本发明公开了一种输水隧道初期支护开裂处治方法，包括首先对掌子面进行初喷混凝土，并封闭围岩；然后对边墙和顶拱增设A25自进式中空锚杆，并按梅花形布置，同时封闭仰拱，把底板换填成C30混凝土，并更换变形拱架；对塌腔部位在拱顶2m的范围内回填C30混凝土，拱顶2m以外采用轻质材料填满空腔，并注浆加固；对初支开裂部位进行固结灌浆；对初期支护开裂段前26~30m的顶拱120°范围增设A25自进式中空锚杆，按梅花形布置；对该段围岩收敛及沉降变形监测，并指导后续施工。本发明通过对区域活动断裂较为破碎的V类围岩施工段初支开裂采用合理措施对变形段进行处理减小后续变形，并在保证输水隧洞后续出渣及材料运输情况下，确保变形段安全平稳，提高施工质量。