本发明提出了基于SERS的体液检测方法及系统，检测方法包括激光修正大光斑积分测量模式和快速点扫描测量模式，激光修正大光斑积分测量模式可快速获取稳定、可重复的拉曼光谱结果；快速点扫描模式可捕获体液中的低浓度疾病相关标记物。基于以上两种测量模式，本方法可实现对体液的整体组分和差异性组分的精准检测。本发明中的系统包括基线处理、光谱标准化、自动寻峰及成像方法，实现光谱数据的快速、客观、大批量处理，及差异性特征峰自动获取。本发明有效实现了快速、稳定、高通量、低成本的表面增强拉曼体液检测，通过检测、分析人体体液的拉曼光谱特征信息，可进行疾病快速预诊代替传统的体液检测方法，实现大面积人群高频普查。