本发明涉及孤岛模式开绕组双馈风力发电微电网系统的谐波消除设备，通过在转子侧变流器的控制器使用定子磁链观测器计算固定电压，使转子侧变流器的控制器的控制方式为外环电压和内环电流控制的双闭环控制，通过直流母线侧变流器的控制器的电压控制和谐波补偿环节，使得全谐振频率下无论发电机参数如何，传递函数均为零，能够完全抑制端口电压扰动的影响。本发明通过磁链定向的矢量控制方式对系统进行控制，利用定子侧变流器对系统谐波进行补偿，能够实现当开绕组双馈电机微电网系统由于带非线性负载运行等因素造成系统谐波较大时，谐波能够有效地被清除。